A dekóder a DNS formájában USB-flash meghajtó

• DNS dekóder, USB-flash-

Az Egyesült Királyságban, hogy létrehozta a legapróbb automatikus dekódolás a genom a világon. Ez jelenik meg a polcokon ebben az évben, és - vonzó ár cédula. A cég azt nem lesz kevésbé érdekes DNS oldalon, egy rab a szerveren.

A cég Oxford nanopórus Technologies bevezetett egy miniatűr eldobható meghatározó szekvencia bázisok a DNS-molekula - Minion.

Teljesen önálló priborchik mérete valamivel nagyobb memória flash meghajtók csatlakoztatott USB-port a laptop vagy PC. Ez tartalmazza mindazokat az elemeket, amelyek szükségesek a teljes genom szekvenálása: mikropotokovye rendszer, egyedi érzékelők és speciális elektronika.

A pontosság a kezdő - szintű szekvenálása meglévő rendszerek, eszköz alkotók állítják.

A készülék termel közvetlenül leolvasható a „betűk” DNS valós időben tükrözik azokat a képernyőn, valamint a rekordok a számítógép memóriájában.

A kutatók előre meghatározni, hogy mennyi szükséges információkat abból a célból, egy élmény, vagy egy töredéke a genetikai kód keresnek, és megáll átirat az eredmény elérésére, hogy gyorsan menjen egy új kísérletet.

A minták előkészítése minion rendszer szintén nem igényel nagy erőfeszítést. A készülék működik, egy dupla-szálú DNS-t, sőt ez nem igényel előzetes amplifikációt.

Egyes esetekben az érzékelő képes megkülönböztetni azonnal molekulát a vér vagy a szérum mintában, és néha szükség lehet egy kis előkezelés keveréket.

További érdekes, hogy az eszköz kegyenc oldali projekt született, hogy hozzon létre egy nagyobb, erősebb újrafelhasználható rendszer szekvenálás - GridION. Mindkettő ugyanazt a technológiát megfejteni a genom, amelyen egy csoportja biokémikusok-Britannia és az Egyesült Államok dolgozott mintegy 20 éve (jobbról a megjelenése a csupasz ötlet). A mechanizmus alapja a polimer membrán beágyazott nano-pórusok. Ez az eszköz egy részét kapjuk kombinációjával természetes (fehérjék) és szintetikus molekulák.

nanopórusok membránon kialakítva, hogy kihagyja bizonyos szigorúan molekula.

A speciálisan kifejlesztett enzimoldatot adunk a mintához, és felveszi a DNS-molekula egymás után tolja át a pórusok keresztül egy fonófejen (lásd a fenti ábrát).

Ebben az időben, a pórus van kötve egy elektronikus áramkör érzékeli az elektromos rezgések. Szerint a sajátos profilját minden készülék kiszámítja az utolsó bázispár, és nagy pontossággal, még nagyon hosszú töredékek „molekula az élet”.

A fehérje nanopórus membrán. Miután megy ionáram, amelyek előfordulnak „zavar”, amelyek különböznek attól függően, hogy milyen típusú áthaladó „kapu” molekulákat. Mértéke szerint eltérítési áram elektronika azonosítja az alap DNS-bázisok.

Ellentétben a többi apró GridION rendszer egyfajta kiszolgáló-dekóderek komplex (a cég felhívja a csomópontok - GridION csomópont).

Minden csomópont egy nyílás eldobható patron. Ez utóbbi magában foglalja a teljes készlet reagensek szükséges a teljes elemzés DNS, és a tényleges chip analizátor kétezer nanopórusok fent leírt.

Node GridION csomópont pontosan méri ionáramok a chipbe, dekódolja és megjeleníti az eredményt szekvenálás. Ezzel párhuzamosan szekvencia a genetikai kód kerül rögzítésre egy külső merevlemezre, vagy egy másik számítógéphez (USB vagy hálózat). Egy nap alatt GridION csomópont képes kiadni tíz gigabájt a bázis szekvencia adatok a vizsgált DNS-t.

GridION egység lehet beállítva, hogy keressen nem csak a mintát és a DNS-analízis, hanem más molekulák - tudós releváns fehérjék, vagy például, robbanásveszélyes vegyületek.

Bár a „szerver” GridION csomópont képes működni, mint egy önálló asztali gépek, a legfeltűnőbb eredmény érhető el, ha több ilyen eszköz van kombinálva rack (szélessége is 19 hüvelyk), és együttesen jelentkezik, az adatcserét közvetlenül dekódolás során.

(Mellesleg, a méretek és csatlakozók GridION csomópont megfelelnek a közös szerver.)

a GridION patronok.

A 2013-as változat miatt ki GridION csomópont már 8000 nanopórus, és működnie kell gyorsabb, mint az előző modell.

Szerint a fejlesztők, 20 ilyen gép egy szerver rack lesz képes dekódolni a teljes genomját egy személy mindössze 15 perc alatt.

Mindkét készülék és GridION (első változat), és egy feltűnő Minion, a tervek, hogy kiadja a piacon 2012-ben. Gyártó kíván létrehozni, versenyképes áron, összehasonlítva a legújabb technológiákat a nagy sebességű dekódolás a genom.

Különösen a „DNS-szekvenáló - flash” kerül kevesebb, mint $ 900.

„kiszolgáló” GridION csomópont és egy sor csomópontok a szerver rack. Egy GridION csomópont fogyaszt kevesebb, mint 50 watt, a cég hangsúlyozza az egyik előnye a készülék.

Itt kell megjegyezni, hogy egy kicsit több mint egy évvel ezelőtt az amerikai cég Life Technologies bevezette asztali személyi genom dekódolás Personal Genome gép, érdemes legalább $ 100,000. Az elv primononny benne eltér GridION technológia, de vannak közös: az automatizált szekvenálás, a tudósok is kifejlesztettek egy mikrochip, amely egyesíti elektronika kémia.

2012 januárjában, a Life Technologies (vagy inkább annak leányvállalata Ion Torrent) megmutatta új modell dekóder genom nevezett Ion Proton. Ez a gép már a becslések szerint $ 149,000, de a chip oldalon, rejtőzik benne, 1000-szer erősebb, mint az előző minta.

Készülék Ion Proton képes olvasni a teljes emberi genom egy nap, amelynek költsége „kellék” $ 1,000.

Ezek az eszközök meg kell szüntetni, mivel a tudósok azt mondják, az egyik szűk számos biológiai és orvosi kutatások - lassú dekódolás a genom.

Nos, ez a feladat, hogy egy viszonylag kis laboratórium, és abban az esetben a dekódolás, flash meghajtók lehet mondani, hogy a DNS-dekódoló technológia a közeljövőben jön szinte minden otthonban, mint ahogy a cukortartalom most az emberek önállóan elemezni vér.